Por que nós usamos Debian? Eu acho que o Debian é uma das distribuições mais estáveis disponíveis. E é tão fácil instalar pacotes no Debian. Qualque rum pode "apt-get install gtypist". O que é tão difícil? Se você não quer o Debian puro, você sempre pode tentar o Knoppix.
Nós temos todos os PCs trabalhando com Debian (exceto um que está com Windows... Eu realmente não sei porquê :) ). Nós basicamente estamos usando o Debian em um pequeno cluster de oito nodos para rodar aplicações MPI usando MPICH. A maioria das coisas funciona logo após a instalação.