Na Bioinformática, todos os computadores, servidores e estações de trabalho, foram padronizados no uso do Debian, no geral devido ao melhor nível de suporte disponível para o Debian e a administração simplificada provida pelo sistema de gerenciamento de pacotes do Debian. Em menor grau, mas ainda muito importante, é também o cuidado e checagem de qualidade que a maioria dos mantenedores colocam em seus pacotes.