Debian blev valgt på grund af den nemme måde at opgradere på og tilføje sikkerhedsopdateringer, og på grund af det store udvalg af pakker. Vi har pt. flere Linux-computerrum med arbejdsmaskiner der Debian, med en skræddersyet installering vha. FAI. Vi bruger også Debian på flere Beowulf-klynger som passes af de studerende, i alt 20 Sun Ultra 5'ere. Afdelingens primære filserver kører også Debian.
Institutionen har pt. fem Debian-baserede servere og er i gang med at erstatte de fleste tilbageværende Red Hat- og Solaris-servere med Debian.